إن التحول في النظام الغذائي للسلمون المستزرع له تأثيرات كبيرة على البيئة والمناخ. لاحظ Hayek أنه من الصعب نسب استهلاك فول الصويا إلى أنواع أسماك فردية، رغم أن أبحاثاً أخرى تظهر زيادة في المكونات القائمة على المحاصيل التي تُطعم للسلمون المستزرع. في النرويج، أكبر منتج للسلمون المستزرع في العالم، كانت 90 في المئة من مكونات العلف بحرية المنشأ في عام 1990، وانخفضت إلى 23 في المئة بحلول عام 2020. وجدت جماعات المناصرة أن 90 في المئة من فول الصويا المُطعم للسلمون المستزرع في النرويج يأتي من ثلاث شركات برازيلية، كل منها مرتبطة بمكونات صويا مصدرها بقع من غابات الأمازون المطيرة تم قطعها بشكل غير قانوني.

وجد بحث آخر أن التحول إلى مكونات قائمة على المحاصيل ضاعف انبعاثات غازات الاحتباس الحراري، لكل كيلوغرام، من الأسماك المستزرعة في أوروبا والمملكة المتحدة من 2000 إلى 2020. قال Cascada: "إنها مقايضة مشكلة واحدة — استغلال بحري — بأخرى — استغلال بري".

تلاحظ بعض الجماعات البيئية أن الزيادة في الطلب على السلمون جاءت بشكل غير متناسب من دول غنية دون عجز غذائي. قال Cascada: "الادعاء هو أن صناعة السلمون هنا لإطعام العالم، لكن ما تفعله حقاً هو إغراق الشمال العالمي بالبروتين غير الضروري بالضرورة على حساب الجنوب العالمي".

في الولايات المتحدة، يدفع المشرعون بقانون أبحاث الاستزراع المائي البحري لأمريكا (MARA) لتوسيع استزراع السلمون في البحر، رغم معارضة المدافعين عن البيئة والصيادين للتشريع.