养殖三文鱼饮食结构的转变正对环境和气候产生显著的下游影响。Hayek 指出，很难将大豆消费归因于单个鱼类品种，但其他研究显示，喂给养殖三文鱼的作物基原料比例在上升。在世界最大的养殖三文鱼生产国挪威，1990 年饲料原料中 90% 为海洋基，到 2020 年降至 23%。倡导团体发现，挪威养殖三文鱼食用的大豆中 90% 来自三家巴西公司，这些公司均与源自亚马逊雨林非法砍伐区域的大豆原料有关联。

其他研究发现，2000 年至 2020 年间，欧洲和英国养殖鱼每公斤温室气体排放量因转向作物基原料而翻倍。"这是在用一个问题——海洋过度开发——换取另一个问题——土地过度开发，" Cascada 说。

一些环保团体指出，三文鱼需求的激增主要来自并无营养赤字的富裕国家。"宣称三文鱼产业是为了喂饱世界，" Cascada 说，"但实际上它只是用全球南方的代价，向全球北方倾销并不一定需要的蛋白质。"

在美国，立法者正推进《美国海洋水产养殖研究法案》（MARA Act）以扩大近海三文鱼养殖，但环保倡导者和渔民反对该立法。