O processo de escrita de uma tese de doutorado envolve dezenas de ideias abandonadas, código espalhado por incontáveis repositórios e centenas de artigos de pesquisa lidos há anos. Ferramentas de IA podem ajudar a sintetizar essas informações. O autor compartilha quatro aplicações específicas: um assistente de pesquisa para encontrar citações, combinar código de múltiplos experimentos para melhorar a reprodutibilidade, verificação de fatos contra artigos citados e geração de perguntas de defesa baseadas no trabalho. Estas podem ser implementadas com uma assinatura básica de uma das empresas de IA. As aplicações não descarregam a largura de banda mental para um sistema de IA e, em alguns casos, até aumentaram o tempo gasto na tese, pois visam produzir um trabalho melhor em vez de simplesmente escrevê-lo.

A primeira aplicação, um buscador de citações, aborda o desafio de recordar artigos específicos de anos de pesquisa. O autor usou um sistema RAG construído com Claude Code, incluindo um arquivo BibTeX com todas as citações e artigos-chave da seção de introdução. Ao escrever, o autor colava a frase e os artigos relevantes como prompt. O autor enfatiza não confiar cegamente na saída da IA e sempre verificar as citações sugeridas retornando aos artigos de pesquisa originais.

As aplicações restantes cobriram consolidação de código para reprodutibilidade, verificação de fatos contra artigos citados e geração de perguntas de defesa. Todos os métodos foram projetados para auxiliar em vez de substituir o esforço intelectual do pesquisador.