Proses penulisan tesis doktor melibatkan puluhan ide yang ditinggalkan, kode yang tersebar di repositori tak terhitung jumlahnya, dan ratusan makalah penelitian yang dibaca bertahun-tahun lalu. Alat AI dapat membantu mensintesis informasi ini. Penulis berbagi empat aplikasi spesifik: asisten penelitian untuk menemukan sitasi, menggabungkan kode dari beberapa eksperimen untuk meningkatkan reproduktibilitas, pemeriksaan fakta terhadap makalah yang dikutip, dan pembuatan pertanyaan pertahanan berdasarkan karya tersebut. Hal ini dapat diimplementasikan dengan langganan dasar dari salah satu perusahaan AI. Aplikasi-aplikasi ini tidak memindahkan beban mental ke sistem AI dan dalam beberapa kasus bahkan menambah waktu yang dihabiskan untuk tesis, karena tujuannya adalah menghasilkan karya yang lebih baik, bukan sekadar menuliskannya.

Aplikasi pertama, pencari sitasi, mengatasi tantangan mengingat makalah spesifik dari bertahun-tahun penelitian. Penulis menggunakan sistem RAG yang dibangun dengan Claude Code, termasuk file BibTeX dengan semua sitasi dan makalah kunci dari bagian latar belakang. Saat menulis, penulis menempelkan kalimat dan makalah relevan sebagai prompt. Penulis menekankan untuk tidak percaya begitu saja pada output AI dan selalu memverifikasi sitasi yang disarankan dengan kembali ke makalah penelitian asli.

Aplikasi tersisa mencakup konsolidasi kode untuk reproduktibilitas, pemeriksaan fakta terhadap makalah yang dikutip, dan pembuatan pertanyaan pertahanan. Semua metode dirancang untuk membantu, bukan menggantikan upaya intelektual peneliti.