El proceso de escritura de una tesis doctoral implica docenas de ideas abandonadas, código disperso en innumerables repositorios y cientos de artículos de investigación leídos hace años. Las herramientas de IA pueden ayudar a sintetizar esta información. El autor comparte cuatro aplicaciones específicas: un asistente de investigación para encontrar citas, combinar código de múltiples experimentos para mejorar la reproducibilidad, verificación de hechos contra los artículos citados y generación de preguntas de defensa basadas en el trabajo. Estas pueden implementarse con una suscripción básica de una de las empresas de IA. Las aplicaciones no descargan la carga mental a un sistema de IA y en algunos casos aumentaron el tiempo dedicado a la tesis, ya que su objetivo es producir un mejor trabajo en lugar de simplemente escribirlo.

La primera aplicación, un buscador de citas, aborda el desafío de recordar artículos específicos de años de investigación. El autor utilizó un sistema RAG construido con Claude Code, que incluía un archivo BibTeX con todas las citas y artículos clave de la sección de antecedentes. Al escribir, el autor pegaba la frase y los artículos relevantes como prompt. El autor enfatiza no confiar ciegamente en la salida de la IA y siempre verificar las citas sugeridas volviendo a los artículos de investigación originales.

Las aplicaciones restantes cubrieron la consolidación de código para la reproducibilidad, la verificación de hechos contra los artículos citados y la generación de preguntas de defensa. Todos los métodos fueron diseñados para asistir en lugar de reemplazar el esfuerzo intelectual del investigador.