Le processus de rédaction d'une thèse de doctorat implique des dizaines d'idées abandonnées, du code dispersé dans d'innombrables dépôts et des centaines d'articles de recherche lus il y a des années. Les outils d'IA peuvent aider à synthétiser ces informations. L'auteur partage quatre applications spécifiques : un assistant de recherche pour trouver des citations, combiner du code provenant de plusieurs expériences pour améliorer la reproductibilité, la vérification des faits par rapport aux articles cités, et la génération de questions de défense basées sur le travail. Celles-ci peuvent être mises en œuvre avec un abonnement de base auprès de l'une des entreprises d'IA. Les applications ne déchargent pas la bande passante mentale vers un système d'IA et, dans certains cas, ont même augmenté le temps consacré à la thèse, car elles visent à produire un meilleur travail plutôt que simplement à l'écrire.

La première application, un chercheur de citations, répond au défi de se souvenir d'articles spécifiques après des années de recherche. L'auteur a utilisé un système RAG construit avec Claude Code, incluant un fichier BibTeX avec toutes les citations et les articles clés de la section d'introduction. Lors de la rédaction, l'auteur collait la phrase et les articles pertinents comme invite. L'auteur insiste sur le fait de ne pas faire aveuglément confiance à la sortie de l'IA et de toujours vérifier les citations suggérées en revenant aux articles de recherche originaux.

Les applications restantes couvraient la consolidation de code pour la reproductibilité, la vérification des faits par rapport aux articles cités et la génération de questions de défense. Toutes les méthodes ont été conçues pour assister plutôt que pour remplacer l'effort intellectuel du chercheur.