কিছু ভাইরাস প্রकोপ শমিত হলে লুপ্ত হওয়া মনে হয়, শুধু আবার উদ্ভূত হতে। বিজ্ঞানীরা সবসময় জানেন না সেগুলো কোন প্রাণীতে লুকিয়ে থাকে — এবং কিভাবে সেগুলো আবার মানুষে ছড়িয়ে পড়া থেকে রোধ করা যায়। সব কিছু কোথাও থেকে আসে। বিপদজনক নতুন ভাইরাসগুলি সাধারণত প্রাণীদের থেকে আসে। মানব ইনফ্লুয়েঞ্জা ভাইরাস বন্য জলজ প্রাণীদের থেকে আসে। হ্যান্টাভাইরাস কৃতকদের থেকে আসে। এমপক্স ভাইরাসও কৃতকদের থেকে আসে, কাঠবিড়ালসহ। মহামারি সৃষ্টিকারী এইচ.আই.ভি.রূপ চিম্পাঞ্জি থেকে এসেছে। ভাইরাস শুধু কোষযুক্ত প্রাণীদের কোষে প্রতিলিপি করতে পারে, যা প্রাণী ভাইরাসকে মানুষের সাথে খাপ খাওয়ার সবচেয়ে সম্ভাব্য করে তোলে। প্রাণী উৎস শনাক্ত করলে বিজ্ঞানীরা অনুমান করতে পারেন কীভাবে এবং কোথায় স্থানান্তর ঘটেছে, প্রতিরোধের উপায় নির্দেশ করে। ১৯৯৮ সালে, নিপাহ ভাইরাস মালয়েশিয়ায় মানুষকে হত্যা করা শুরু করে, ফলভোজ বাদুড়রা আমের বাগানের দিকে আকৃষ্ট হয়েছিল, যেটি শূকর ফার্মের উপরে ছিল। বননাশ বাদুড়দের বাগানের দিকে ঠেলে দিয়েছিল, শূকর সংক্রমণ এবং মানুষে ছড়িয়ে পড়ার দিকে নিয়ে যাচ্ছিল। বাগানকে শূকর ফার্ম থেকে আলাদা করলে ভবিষ্যতের প্রकोপ রোধে সাহায্য করেছিল। ইবোলাভাইরাসের জন্য, সাধারণ জ্ঞান বলে সেগুলো বাদুড় থেকে আসে, কিন্তু প্রমাণের অভাব রয়েছে। ইবোলা মধ্য ও পশ্চিম আফ্রিকায় দশক দশক প্রकोপ সৃষ্টি করেছে, বর্তমান ডিআরসি প্রकोপে ৭,৪০০ এর বেশি কেস রয়েছে। যে প্রাণীতে একটি ভাইরাস বাস করে সেটিকে রিজার্ভয়ার হোস্ট বলা হয়। যখন ভাইরাস মানুষে প্রবেশ করে, তাকে স্পিলওভার বলা হয়। এই ধারণাগুলো প্রकोপ নিয়ন্ত্রণের জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ, যদিও প্রতিরোধের জন্য সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ প্রশ্ন এখনো উত্তরহীন।