Os escores de risco poligênico (PRS) preveem o risco de doenças a partir de variantes genéticas, mas seu uso clínico é limitado porque os estudos de associação genômica ampla (GWAS) históricos se concentraram em coortes europeias, causando quedas de precisão em populações não europeias. Diferenças nas arquiteturas genéticas e frequências alélicas contribuem para esse problema, e conduzir novos GWAS é caro. O aprendizado por transferência de GWAS existentes centrados na Europa, aumentado com dados da população-alvo, oferece uma solução.

Este estudo avaliou o desempenho do PRS em uma população-alvo não europeia, variando os tamanhos das populações-alvo e europeia em oito características clínicas. Usando o UK Biobank (UKB) e o Biobanco do Japão (BBJ), que inclui quase 200 mil indivíduos japoneses, os pesquisadores realizaram experimentos de ablação de conjuntos de dados. As características incluíram índice de massa corporal (IMC), pressão arterial, níveis de colesterol e contagens de células sanguíneas.

Três métodos foram testados: transferibilidade direta de variantes usando GWAS de descoberta do UKB com rede elástica, meta-análise combinando dados japoneses durante a descoberta de variantes e PRS-CSx para lidar com a diversidade de desequilíbrio de ligação. Os modelos foram avaliados em amostras BBJ retidas. Os resultados mostraram que mais dados nem sempre é melhor para a predição de PRS entre populações, fornecendo diretrizes empíricas para otimizar o desempenho preditivo em populações-alvo.

Entidades-chave: Empresas: Google | Locais: UK Biobank, Biobanco do Japão