エルニーニョは過去1,000年におけるどの時期よりも現在強力です。研究は、ミシガン大学のJulie Coleが率いるチームによって行われ、ガラパゴスの化石珊瑚を用いて1,000年間の海面温度記録を再構築しました。これらの珊瑚は年間1〜2センチメートル成長し、カルシウム炭酸塩の骨格を形成し、その化学組成が水温を反映します。ストロンチウム対カルシウム比と酸素同位体の分析により、チームは1100年代から始まる月次温度ログを作成しました。結果は、現代のエルニーニョ事件が工業化前時代（1000–1850年）と比較して36.5%より変動が大きいことを示しており、現在の変動は1851–1982年の基準値より16.2%高いことが分かっています。特に、偏度が正値となり、より熱い事件が強くなっていることを示唆しています。ガラパゴス地方は東太平洋に位置し、長期的な珊瑚分析に適した唯一の場所でした。研究はENSOの前例のない強度を確認していますが、人為的要因による直接的な責任を確定するものではありません。ただし、気候モデルは人為的な温暖化がこれらの自然な変動を強化していると示唆しています。