Ученые использовали инструменты ИА для проектирования белков, чтобы создавать ферменты, расщепляющие пептидные связи, которые normally стабильны веками. Изъяв Catalytic cores двух типов протеаз — цинк-протеазы и цистеин-протеазы — и заменив остальную структуру белков, они создали кастомные ферменты, способные резать конкретные белки пополам. Эти спроектированные ферменты тестировались на белках, связанных с нейрологическими заболеваниями, продемонстрировав потенциал для целевых терапевтических приложений. Процесс зависит от обратного превращения пептидной связи, что требует ферментного катализа из-за inherent стабильности связи. Цинк-протеаза использует атом цинка для координации связи и активации молекулы воды, а цистеин-протеаза формирует временный фермент-предмет перед гидролизом. Оба механизма зависят от точного пространственного расположения ключевых аминокислот в каталитическом центре, остальная часть белка влияет на специфичность. Этот подход обходит естественное эволюционное разнообразие, позволяя быстро создавать высокоспецифические протеазы. Работа, проведенная в основном исследователями лаборатории Дэвида Бейкера в Университете Вашингтон, открывает новые возможности для лечения болезней путем расщепления вредных белков.
Источник: Ars Technica · Сводку подготовил HeadlinesBriefing