Antes del lanzamiento del iPhone Duo, Mark Gurman de Bloomberg informó que Apple estaba considerando un nuevo Apple Pencil para iPhone Duo, aunque era poco probable que la compañía lo continuara. El evento principal del iPhone Duo confirmó el soporte para el Apple Pencil USB-C. Apple había diseñado el Duo para ser compatible con el Apple Pencil y inicialmente planeó un modelo más pequeño para adherirse al lado de la bisagra.

Según Gurman, ese lápiz encontró problemas técnicos antes de la producción en masa, lo que llevó a Apple a descartarlo y adoptar el Apple Pencil USB-C tradicional. Después del evento principal, el sitio web de Apple señaló que el soporte para Apple Pencil no estaría disponible en el lanzamiento debido a que el Duo no fue diseñado inicialmente para el Apple Pencil USB-C, requiriendo pruebas extensivas. Apple afirmó que el soporte estaría listo para finales de 2026, con actualizaciones de software y pruebas de compatibilidad interna actualmente en curso.

Aún no está claro si los problemas técnicos provinieron del lápiz mismo o de la capacidad de carga magnética del Duo. Si es lo primero, Apple podría seguir lanzando el accesorio más adelante.