Vor der Einführung des iPhone Duo berichtete Mark Gurman von Bloomberg, dass Apple einen neuen Apple Pencil für das iPhone Duo in Betracht zog, obwohl es unwahrscheinlich schien, dass das Unternehmen dieses Projekt weiterverfolgen würde. Die Keynote des iPhone Duo bestätigte die Unterstützung für den USB-C Apple Pencil. Apple hatte den Duo so entwickelt, dass er mit dem Apple Pencil kompatibel ist, und plante ursprünglich ein kleineres Modell, das an der Scharnierseite angebracht werden könnte.

Laut Gurman stieß dieser Stift vor der Massenproduktion auf technische Probleme, wodurch Apple ihn verwarf und stattdessen den traditionellen USB-C Apple Pencil übernahm. Nach der Keynote stellte Apples Website fest, dass die Unterstützung für den Apple Pencil zum Start nicht verfügbar sein würde, da der Duo ursprünglich nicht für den USB-C Apple Pencil ausgelegt war und umfangreiche Tests erforderlich wären. Apple erklärte, dass die Unterstützung bis Ende 2026 bereit sein wird, wobei derzeit Software-Updates und interne Kompatibilitätstests laufen.

Es bleibt unklar, ob die technischen Probleme vom Stift selbst oder von der magnetischen Ladefähigkeit des Duo stammen. Wenn ersteres zutrifft, könnte Apple das Zubehör später dennoch auf den Markt bringen.