Die Forschung mit NetBSD erstreckt sich über vielfältige Gebiete, von Satellitennetzwerken bis zur Protokolsentwicklung. Das NASA Lewis Research Center nutzt NetBSD fast ausschließlich, um TCP-Protokolle für Satellitenkommunikation zu untersuchen. Sie testen Erweiterungen wie selektive Bestätigungen und größere Anfangsfenster, um die Leistung zu verbessern.

Das KAME-Projekt hat IPv6 und IPsec erfolgreich in BSD UNIX-Kernel implementiert und wurde im Juni 1999 in NetBSD-current integriert. Das Institut für Medienkommunikation, Abteilung für medienkommunikative Wertschöungslösungen, führt Projekte auf NetBSD durch, einschließlich Netzwerkzugriffskontrolle und Tunneln unsicherer Protokolle. NEC Europe Network Laboratories, gegründet in Heidelberg, Deutschland im Jahr 1997, konzentriert sich auf cutting-edge Netzwerktechnologien und next-generation Internetprotokolle.

TCP Vegas, eine erweiterte Slow-Start-Flusssteuerung ursprünglich von der Universität von Arizona, wurde von Prof. Peter B. Danzig und seiner Gruppe bei usc.edu auf NetBSD 1.0 portiert. Weitere bemerkenswerte Projekte umfassen das UVM-Virtuellen-Speichersystem und das Space Acceleration Measurement System II (SAMS-II).