A pesquisa usando NetBSD abrange diversos campos, desde redes de satélite até desenvolvimento de protocolos. O Centro de Pesquisa NASA Lewis utiliza quase que exclusivamente o NetBSD para investigar protocolos TCP para comunicações satelitais. Eles estão testando extensões como reconhecimentos seletivos e janelas iniciais maiores para melhorar o desempenho.

O projeto KAME implementou com sucesso IPv6 e IPsec nos kernels de BSD UNIX, mesclando-se ao NetBSD-current em junho de 1999. O Instituto de Comunicação de Mídia, departamento de Soluções de Valor Adicionado em Comunicação de Mídia, conduz projetos no NetBSD, incluindo Controle de Acesso à Rede e túneis de protocolos inseguros. A NEC Europe Network Laboratories, estabelecida em Heidelberg, Alemanha, em 1997, concentra-se em tecnologias de rede de ponta e protocolos de Internet de próxima geração.

TCP Vegas, um controle de fluxo de início lento estendido originalmente da Universidade do Arizona, foi portado para o NetBSD 1.0 pelo Prof. Peter B. Danzig e seu grupo em usc.edu. Outros projetos notáveis incluem o Sistema de Memória Virtual UVM e o Sistema de Medição de Aceleração Espacial II (SAMS-II).