Исследования с использованием NetBSD охватывают различные области, от спутниковых сетей до разработки протоколов. Исследовательский центр NASA Льюис использует NetBSD почти исключительно для изучения протоколов TCP для спутниковых коммуникаций. Они тестируют расширения, такие как селективные подтверждения и более большие начальные окна, чтобы улучшить производительность. Проект KAME успешно реализовал IPv6 и IPsec в ядрах BSD UNIX, объединившись с NetBSD-current в июне 1999 года. Институт медиа-коммуникаций, отдел решений с добавленной стоимостью в медиа-коммуникациях, проводит проекты на базе NetBSD, включая управление доступом к сети и туннелирование небезопасных протоколов. NEC Europe Network Laboratories, основанная в Гейдельберге, Германия в 1997 году, сосредоточена на передовых сетевых технологиях и протоколах следующего поколения Интернета. TCP Vegas, расширенный протокол управления потоком медленного запуска, изначально из Университета Аризоны, был перенесён на NetBSD 1.0 профессором Питером Б. Данзигом и его группой в usc.edu. Другие значительные проекты включают систему виртуальной памяти UVM и систему измерения ускорения в космосе II (SAMS-II).