Penelitian menggunakan NetBSD mencakup berbagai bidang, dari jaringan satelit hingga pengembangan protokol. Pusat Penelitian NASA Lewis menggunakan NetBSD hampir secara eksklusif untuk menyelidiki protokol TCP untuk komunikasi satelit. Mereka sedang menguji ekstensi seperti pengakuan selektif dan jendela awal yang lebih besar untuk meningkatkan kinerja.

Proyek KAME berhasil mengimplementasikan IPv6 dan IPsec ke dalam kernel BSD UNIX, yang bergabung ke dalam NetBSD-current pada Juni 1999. Institusi Komunikasi Media, departemen Solusi Nilai Tambah Komunikasi Media, melakukan proyek-proyek di NetBSD, termasuk Kontrol Akses Jaringan dan menggali protokol tidak aman. NEC Europe Network Laboratories, didirikan di Heidelberg, Jerman pada 1997, berfokus pada teknologi jaringan mutakhir dan protokol Internet generasi berikutnya.

TCP Vegas, kontrol aliran slow-start yang diperluas aslinya dari University of Arizona, diport ke NetBSD 1.0 oleh Prof. Peter B. Danzig dan kelompoknya di usc.edu. Proyek lain yang patut dicatat termasuk Sistem Memori Virtual UVM dan Sistem Pengukuran Akselerasi Ruang II (SAMS-II).