Jonathan Penyu, hewan darat hidup terlama di dunia, masih melangkah di usia sekitar 194 tahun. Sekarang, ilmuwan menemukan beberapa rahasia umur Jonathan dengan mengurun genom-nya pertama kalinya, sesuai dengan penelitian yang dipublikasikan Rabu di Science Advances. Jonathan, seekor Penyu raksasa Aldabra (Aldabrachelys gigantea), melahirkan sekitar 1832 di kepulauan Seychelles, dan ketika Charles Darwin menerbitkan On the Origin of Species, Jonathan sudah dalam usia dua puluhan.
Pada tahun 1880-an, Jonathan dibawa ke pulau Selahem yang terpencil, bersama dengan tiga penyu lain, sebagai hadiah kepada gubernur kolonial Britania. Ia tinggal di sana sejak itu. Foto: WikipediaPenyu raksasa Aldabra sering menjadi centenarians, tetapi Jonathan adalah keluar utama bahkan untuk spesiesnya karena ia mendekati hampir 200 tahun di planet ini.
Untuk lebih memahami umurnya yang ekstrem, para peneliti menilai genom Jonathan berdasarkan swab pipi dan membandingkannya dengan genom penyu lain, termasuk yang berusia 36 tahun bernama Tank. Hasilnya menunjukkan bahwa Jonathan memiliki “variasi genetik unik di maggioritas jalur penuaan” termasuk perbaikan DNA, regulasi insulin, fungsi mitochondri, dan “low entropy” metilasi, dilaporkan penelitian. “Penuaan sangat rumit, dan semua ini berbagai muka penanda”, ujar Stephen Clark, peneliti penuaan dari organisasi non-profit Kallel Foundation dan penulis penelitian, dalam panggilan dengan 404 Media. “Maka dari itu penelitian Jonathan ini sangat menarik. Kita masih hanya di awal mencoba memahami penuaan.”Penelitian ini bukan pekerjaan yang mudah.
Clark pertama kali menghubungi penjaga Jonathan pada 2017, tetapi butuh beberapa negosiasi untuk menentukan cara terbaik untuk mendapatkan informasi genetik penyu. Pengambilan darah dianggap terlalu berisiko, jadi Jonathan dipaksa membuka mulut untuk mengambil swab. Hasilnya tertunda karena sampel awal tidak lengkap, pandemi Covid-19, dan regulasi baru yang mengatur akses ke Jonathan.
Abonemen 404 Media untuk mendapatkan The Abstract, majalah berita tentang berita dan penelitian ilmu paling menarik dan memikat minggu ini. Setelah bertahun-tahun pertukaran mundur, sampel dikirim dari Saint Helena ke Florida oleh Pasukan Angkasa AS. Hasilnya menunjukkan bahwa Jonathan memiliki banyak varian genetik yang tim mengharapkan melihat, berdasarkan penelitian tentang individu dan populasi yang panjang umur.
Ini mencakup varian yang terkait dengan perbaikan DNA, pemeliharaan urutan yang disebut telomeres, dan proses resikl sel yang dikenal sebagai autofagi. Namun para peneliti menemukan kejutan di “metiloma” Jonathan, yang merupakan sekumpulan modifikasi berdasarkan metilik yang terlibat dalam ekspresi gen. Subset metiloma Jonathan yang berkaitan dengan proses mitochondrialsan abnormally pristine, or “low entropy.” Foto: Pemerintah Saint Helena, Communication Hub“Jonathan benar adalah pertama kalinya jenisnya yang memiliki analisis ini, dan kita juga dapat melakukan metiloma untuk penyu yang lebih muda,” kata Clark. “Kita sebenarnya membandingkannya dengan penyu usia lima tahun, jadi ada perbedaan 189 tahun antara metilomanya.
Siapa pun pernah tidak dilakukan bahkan pada manusia, karena manusia tidak hidup sampai umur begitu lama. Salah satu hal yang membuat kita sangat menarik: bagaimana metiloma ini berubah dengan umur?”Sedangkan mayoritas genom Jonathan menunjukan tanda entropi yang sebanding dengan usianya, mitiloma mitochondrianya sebanding dengan penyu usia lima tahun, menandakan bahwa jalur ini kemungkinan besar berperan khusus dalam usianya yang lanjut. Namun, Clark mengatakan bahwa butuh riset lebih lanjut untuk mengikuti upah tersebut dan mengurai jaringan genetik yang kompleks yang memengaruhi penuaan dan umur. “Kita tertarik pada spesies umur panjang seperti Jonathan karena kita bisa menemukan target lain,” kata Clark tentang kerja tim di Kallel Labs. “Tujuan akhir perusahaan adalah mempengaruhi healthspan dan umur manusia.”Seputar Jonathan, ia melanjutkan...
Sumber: Hacker News · Diringkas oleh HeadlinesBriefing