С момента выхода Borderlands 2 сцена моддинга игры была очень активна, добавляя кучу улучшений качества и веселых трюков для лут-шутера, определяющего жанр. Один из моддеров, который называется Enderkiller124 в X, работал над реализацией некоторых функций и персонажей из Borderlands: The Pre-Sequel в Borderlands 2, поскольку обе игры происходят примерно в одно и то же время, а The Pre-Sequel была построена на большей части той же базовой технологии и движка, что и Borderlands 2. Мод, известный как Project Moonshot, начал как способ играть персонажей и лазерное оружие The Pre-Sequel в Borderlands 2, что уже показывало обещание, по клипам, показанным в аккаунте моддера на X, но с тех пор превратился в полный порт The Pre-Sequel в Borderlands 2. Концептуально, это позволило бы игрокам проходить квесты The Pre-Sequel как персонажи Borderlands 2 и с оружием BL2, и наоборот. Мод еще не завершен, но можно отслеживать прогресс разработки в аккаунте моддера на X. Моддер уже показал несколько областей TPS с персонажами BL2 и внутриигровыми функциями, например Grinder-крафтер в Concordia, оружие TPS, работающее на Pandora, и полную модель Concordia и материалы, отрендеренные в Borderlands 2.